Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms