Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms