Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms