Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPS28P62857 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 599.4 ms