Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF3P57682 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF3P57682 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF3P57682 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms