Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL23P55773 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL23P55773 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL23P55773 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms