Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRAP54198 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRAP54198 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRAP54198 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRAP54198 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRAP54198 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRAP54198 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIRAP54198 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIRAP54198 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms