Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA4P51532 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA4P51532 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA4P51532 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms