Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNTAP49354 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNTAP49354 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNTAP49354 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms