Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSN1S1P47710 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms