Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP5P45974 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP5P45974 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP5P45974 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP5P45974 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP5P45974 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP5P45974 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms