Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL35P42766 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL35P42766 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL35P42766 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL35P42766 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL35P42766 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL35P42766 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL35P42766 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL35P42766 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL35P42766 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL35P42766 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL35P42766 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL35P42766 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms