Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GGCXP38435 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GGCXP38435 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GGCXP38435 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GGCXP38435 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GGCXP38435 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GGCXP38435 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GGCXP38435 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GGCXP38435 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GGCXP38435 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms