Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTNNB1P35222 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNB1P35222 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms