Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A5P29400 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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