Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
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