Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB2P26583 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB2P26583 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms