Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSSP25774 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSSP25774 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSSP25774 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSSP25774 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms