Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms