Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms