Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSPP15924 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
DSPP15924 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSPP15924 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSPP15924 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSPP15924 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSPP15924 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms