Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms