Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT10P13645 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT10P13645 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT10P13645 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT10P13645 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT10P13645 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT10P13645 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms