Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FCER1AP12319 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms