Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RALAP11233 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RALAP11233 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RALAP11233 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RALAP11233 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RALAP11233 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RALAP11233 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RALAP11233 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALAP11233 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALAP11233 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RALAP11233 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RALAP11233 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RALAP11233 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RALAP11233 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RALAP11233 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RALAP11233 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms