Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC172P0C7W6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms