Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTA3P0C7M3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms