Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB1P08034 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB1P08034 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms