Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms