Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CYBBP04839 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYBBP04839 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYBBP04839 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYBBP04839 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYBBP04839 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYBBP04839 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYBBP04839 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYBBP04839 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms