Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA1P01562 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA1P01562 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms