Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL5O76039 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms