Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITX3O75364 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX3O75364 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX3O75364 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX3O75364 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PITX3O75364 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms