Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms