Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN4O43707 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms