Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1GO43497 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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