Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNAB3O43448 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms