Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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HOXA2O43364 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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HOXA2O43364 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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HOXA2O43364 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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HOXA2O43364 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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HOXA2O43364 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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HOXA2O43364 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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HOXA2O43364 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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