Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP290O15078 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP290O15078 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP290O15078 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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CEP290O15078 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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CEP290O15078 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP290O15078 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
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CEP290O15078 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP290O15078 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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CEP290O15078 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP290O15078 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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CEP290O15078 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP290O15078 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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CEP290O15078 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP290O15078 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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