Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms