Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRGMA1A4Y4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms