Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLRN2A0PK11 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms