Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQF3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms