Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD2APQ9Y5K6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD2APQ9Y5K6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms