Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ICE1Q9Y2F5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ICE1Q9Y2F5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms