Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPCN1Q9ULQ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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TPCN1Q9ULQ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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