Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC9Q9UKV0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms