Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP36Q9P275 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms