Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSENENQ9NZ42 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSENENQ9NZ42 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSENENQ9NZ42 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSENENQ9NZ42 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSENENQ9NZ42 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSENENQ9NZ42 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSENENQ9NZ42 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms