Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RDH8Q9NYR8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms